本科论文查重知网和GraduateThesis都是学术领域常用的查重工具，但在具体使用上有一些区别。知网作为国内较知名的查重平台，提供了大量的本地文献库资源，对国内学术论文的查重效果较好。而GraduateThesis则更注重国际文献库的覆盖，对于涉外论文的查重有一定优势。在算法方面，知网采用了较为传统的查重算法，而GraduateThesis则引入了一些先进的文本分析技术，能够更准确地识别文本相似度。总体来说，用户可以根据自己的需求和论文来源选择合适的查重工具。

在使用便捷性上，知网相对简单易用，用户只需上传文档即可进行查重，操作较为方便快捷。而GraduateThesis在使用上可能稍显复杂，需要用户对软件功能有一定了解才能更好地利用其功能。然而，正是因为其功能较为复杂，GraduateThesis在一些专业领域的查重效果可能会更好，能够更准确地检测出文本相似度。因此，用户在选择查重工具时，需要根据自己的需求和熟练程度来决定使用哪种工具。